MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	TCA	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017479	TGA	2	6	83	88	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017479	TTA	2	6	122	127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017479	TTC	2	6	196	201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017479	GGA	2	6	235	240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017479	CAA	2	6	295	300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017479	CAT	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017479	TGGT	2	8	433	440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017479	CTTG	2	8	456	463	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017479	CAT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017479	TCA	2	6	572	577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017479	GCCG	2	8	610	617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017479	GCT	2	6	638	643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017479	CCG	2	6	668	673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017479	GGC	2	6	700	705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017479	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017479	GC	3	6	726	731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017479	TCG	2	6	783	788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017479	TGAT	2	8	796	803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017479	ATG	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017479	TCAA	2	8	845	852	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017479	AAT	2	6	868	873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017479	ATTC	2	8	969	976	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017479	ACC	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017479	CGG	2	6	1085	1090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017479	GTA	2	6	1135	1140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017479	TTTA	2	8	1256	1263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017479	GCA	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017479	ATG	2	6	1297	1302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017479	TGG	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839614
31	NC_017479	GGC	2	6	1355	1360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839614
32	NC_017479	CTT	2	6	1366	1371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839614
33	NC_017479	GGT	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839614
34	NC_017479	CG	3	6	1453	1458	0 %	0 %	50 %	50 %	385839614
35	NC_017479	GAA	2	6	1492	1497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839614
36	NC_017479	GTA	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839614
37	NC_017479	CGG	2	6	1579	1584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839614
38	NC_017479	AGTGCC	2	12	1722	1733	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385839614
39	NC_017479	GTT	2	6	1774	1779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839614
40	NC_017479	CT	3	6	1848	1853	0 %	50 %	0 %	50 %	385839614
41	NC_017479	AAT	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839614
42	NC_017479	CTC	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017479	AACTC	2	10	2038	2047	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017479	AT	3	6	2196	2201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017479	ATA	2	6	2243	2248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017479	GAAA	3	12	2264	2275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017479	TAAC	2	8	2320	2327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017479	TGAG	2	8	2342	2349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017479	AGTA	2	8	2356	2363	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017479	AAG	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017479	CTT	2	6	2380	2385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017479	CCG	2	6	2495	2500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017479	TAA	2	6	2561	2566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017479	T	6	6	2567	2572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017479	TTA	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017479	CAG	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017479	CAAT	2	8	2643	2650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017479	TGA	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017479	CAT	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017479	AAG	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017479	GAC	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017479	TTTA	2	8	3068	3075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017479	TGT	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017479	GTC	2	6	3142	3147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017479	CGT	2	6	3191	3196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017479	ACT	2	6	3253	3258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017479	GCT	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017479	AGA	2	6	3343	3348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017479	AATTT	2	10	3388	3397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017479	AT	3	6	3425	3430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017479	ATA	2	6	3472	3477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017479	TAAA	2	8	3511	3518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017479	TTA	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
74	NC_017479	TAT	2	6	3541	3546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
75	NC_017479	AAC	2	6	3617	3622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
76	NC_017479	AGTA	2	8	3692	3699	50 %	25 %	25 %	0 %	385839615
77	NC_017479	ATT	2	6	3745	3750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
78	NC_017479	TGC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839615
79	NC_017479	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
80	NC_017479	ATG	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839615
81	NC_017479	GCA	2	6	3891	3896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839615
82	NC_017479	ATAA	2	8	3939	3946	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
83	NC_017479	AAC	2	6	3977	3982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
84	NC_017479	ACA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839615
85	NC_017479	AAAT	2	8	4112	4119	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
86	NC_017479	TTA	2	6	4237	4242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
87	NC_017479	CTG	2	6	4273	4278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839615
88	NC_017479	TGG	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839615
89	NC_017479	TCA	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839615
90	NC_017479	TGG	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839615
91	NC_017479	GAT	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839615
92	NC_017479	TAA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839615
93	NC_017479	ATT	2	6	4375	4380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839615
94	NC_017479	TAA	2	6	4381	4386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839615
95	NC_017479	AT	3	6	4418	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	385839615
96	NC_017479	TC	3	6	4446	4451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017479	AATG	2	8	4505	4512	50 %	25 %	25 %	0 %	385839616
98	NC_017479	A	6	6	4553	4558	100 %	0 %	0 %	0 %	385839616
99	NC_017479	ATTA	2	8	4569	4576	50 %	50 %	0 %	0 %	385839616
100	NC_017479	CT	3	6	4577	4582	0 %	50 %	0 %	50 %	385839616
101	NC_017479	ATT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
102	NC_017479	AAAT	2	8	4612	4619	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
103	NC_017479	AAG	2	6	4678	4683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
104	NC_017479	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
105	NC_017479	AAG	2	6	4807	4812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839616
106	NC_017479	ATT	2	6	4813	4818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
107	NC_017479	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839616
108	NC_017479	TGA	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839616
109	NC_017479	AAAT	2	8	4838	4845	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
110	NC_017479	AAT	2	6	4875	4880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839616
111	NC_017479	GAAAT	2	10	4926	4935	60 %	20 %	20 %	0 %	385839616
112	NC_017479	GGTT	2	8	4969	4976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017479	AGA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017479	CAAT	2	8	5114	5121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017479	TGA	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017479	CAT	2	6	5285	5290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017479	AAG	2	6	5408	5413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017479	GAC	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017479	TTTA	2	8	5539	5546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017479	TGT	2	6	5563	5568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017479	GTC	2	6	5613	5618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017479	CGT	2	6	5662	5667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017479	ACT	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017479	GCT	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017479	AGA	2	6	5816	5821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017479	TAAGCT	2	12	5828	5839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017479	AATTT	2	10	5861	5870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017479	T	7	7	5982	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017479	TAT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017479	TAG	3	9	6077	6085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017479	ATA	2	6	6097	6102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017479	TTA	2	6	6139	6144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017479	CTA	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017479	ACT	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017479	ATG	2	6	6208	6213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017479	AGC	3	9	6251	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017479	AAC	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017479	CTT	2	6	6288	6293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017479	AGA	2	6	6311	6316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017479	TGA	2	6	6371	6376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017479	ATT	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017479	ATT	2	6	6512	6517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017479	GAT	2	6	6569	6574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017479	GCA	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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